水平定向钻孔机施工将钻机擦洗干净，检查钻机在运输途中有无损伤，螺栓、油路接头有无松动；检查柴油机、水、机油、柴油；检查泥浆泵机油；小型水平定向钻孔机检查动力头机油、液压油是否缺少，检查各黄油嘴上是否加黄油，检查其它所有需润滑或冷却部位是否需添加润滑油或水，给钻杆钻头的丝扣加丝扣油；连接好油路油管、水管、电路；钻具、工具堆放整齐；动力站上方，机械运动的部件及附近不能放置工具和杂物；准备泥浆用水。

肇庆水平定向钻孔机在风化花岗岩层钻进过程中若钻头遇到岩脉或在卵石层钻进过程中遇到较大粒径的卵石时，钻孔轨迹都可能较明显地偏离设计轨迹，这时钻头的偏向很难预料。操作人员在意识到钻头遇到硬物或较难钻进情况等微小变化时，应马上停钻，检验钻头的位置。此时，应降低钻压，缓慢给进，让钻头慢慢地通过该区域。钻进时，应较频繁地检测钻头的位置。当钻头遇到较硬地层，通常需要加大钻压。但是，小型水平定向钻孔机钻压加大后会引起孔内钻杆弯曲。若钻杆弯曲部位的地层较软，弯曲的钻杆会使钻孔扩大。控向探头只能确定钻头的位置，很难确定这种由钻杆弯曲而形成的钻孔轨迹。在这种情况下，要适当降低钻压，尝试采用冲击钻进的方法通过硬地层，同时，增加泵量或喷射作用或许有助于软化障碍物。

肇庆水平定向钻孔机主机的动力系统一般为柴油发动机。柴油机作为动力源,其功率是衡量钻机施工能力的指标之一。但在钻机钻进回拖过程往往需要钻机以恒定的荷载运行,因此发动机的连续功率显得更重要。为了降低劳动强度,提高劳动效率,主机一般装备了钻杆自动装卸装置。钻进时,钻机自动从钻杆箱中移取钻杆,旋转加接到钻杆柱上。小型水平定向钻孔机回拖时,正好相反。有的还装备了润滑油自动涂抹装置,对钻杆连接头螺纹的润滑有助于延长钻杆的寿命。钻机在工作中应完全固定。如果在钻进拖拉过程中发生移动,一方面有可能造成发动机损坏,另一方面会降低推拉力,造成孔内功率损失。目前最新钻机都有自动液压锚固系统,靠自身功率把锚杆钻入土层,在干燥土层一般用直锚杆,在潮湿土层用螺旋锚杆。

施工中避免大直径钻杆接小直径钻杆（即大小钻杆混合使用）防止小钻杆因强度不够被折断或变形。水平定向钻孔机施工注意用虎钳夹钻杆时，不要夹母接头的母扣部分，防止母扣被夹变形。注意装接钻杆时，上扣预紧力应控制在15Mpa之内，防止因压力过大卸扣困难。避免用火烤接头减低接头的机械性能，（尤其是母接头）影响使用寿命。肇庆水平定向钻孔机不预紧，螺纹连接摆动，造成螺纹互相研磨牙顶变尖，侧面产生棱脊，导致螺纹损坏或产生粘扣现象。不预紧，母扣台阶未压紧，可导致公扣接头螺纹根部疲劳折断；在高压液流的作用下，母接头被刺穿，产生刺蚀现象，易导致母接头纵裂。